Eukaryotik hüceyrənin əmələ gəlməsi ikinci ən vacib (həyatın özünün yaranmasından sonra) təkamül hadisəsi idi. Eukariotlar və prokaryotik orqanizmlər arasındakı əsas və əsas fərq, daha inkişaf etmiş bir genom sisteminin olmasıdır. Hüceyrə nüvəsinin görünüşü və inkişafı sayəsində birhüceyrəli orqanizmlərin müntəzəm olaraq dəyişən mövcudluq şərtlərinə uyğunlaşma dərəcəsi və gen sisteminə əhəmiyyətli irsi dəyişikliklər daxil etmədən tez uyğunlaşma qabiliyyəti kəskin şəkildə artmışdır.
Sitoplazması aktiv metabolik proseslər sahəsi olan, genetik məlumatın saxlanması, oxunması və təkrarlanması zonasından uğurla ayrılmış eukariotik hüceyrənin sonrakı bioloji təkamülə qadir olduğu ortaya çıxdı. Bu epoxal və taleyüklü təkamül hadisəsi, alimlərin fikrincə, ən geci 2,6 milyard il əvvəl iki geoloji mərhələnin - arxey və proterozoyun qovşağında baş verib.
Bioloji strukturların uyğunlaşma qabiliyyətinin və sabitliyinin artması tam hüquqlu bioloji təkamül üçün əvəzsiz şərtdir. Məhz yüksək uyğunlaşma qabiliyyətinə görə eukaryotik hüceyrə mürəkkəb struktur təşkilatı olan çoxhüceyrəli orqanizmlərə təkamül edə bildi. Həqiqətən də çoxhüceyrəli bioloji sistemlərdə eyni genomlu hüceyrələr dəyişən şəraitə uyğunlaşaraq həm morfoloji xüsusiyyətlərinə, həm də funksionallığına görə tamamilə fərqli toxumalar əmələ gətirirlər. Bu, eukariotların böyük təkamül qələbəsidir ki, bu da planetdə belə möhtəşəm müxtəliflikdə həyat formalarının yaranmasına və insanın özünün təkamül arenasına daxil olmasına səbəb olur.
Eukariot tipli hüceyrələrin quruluşu prokariotlara xas olmayan bir sıra xarakterik xüsusiyyətlərə malikdir. Eukaryotik hüceyrədə xromosom strukturlarında cəmləşmiş çoxlu miqdarda genetik material (90%) var ki, bu da onların diferensiasiyasını və ixtisaslaşmasını təmin edir. Hər hansı bir eukaryotik hüceyrə ayrı bir nüvənin olması ilə xarakterizə olunur. Bu hüceyrə tipinin əsas fərqləndirici xüsusiyyətidir. Prokaryotlardan digər mühüm fərq eukaryotik hüceyrənin orqanoidləridir - daimi və müxtəlif hüceyrədaxili strukturlar.
Eukaryotik hüceyrə, prokaryotik hüceyrə ilə müqayisədə, müxtəlif maddələrin qavranılması üçün daha mürəkkəb çoxmərhələli sistemə malikdir. Təbiətdə eukaryotik tipli tipik universal hüceyrə yoxdur. Onların hamısıtəkamül uyğunlaşması ehtiyacı ilə əlaqədar olan inanılmaz müxtəliflik ilə xarakterizə olunur. Eukaryotların çox mühüm xüsusiyyəti onların xas kompartmentalizasiyasıdır - hüceyrədaxili membranla ayrılmış ayrı hüceyrə bölmələrində bütün biokimyəvi proseslərin lokallaşdırılması. Eukariotların bir sıra mürəkkəb struktur komponentləri var. Membran sistemi kimi; əsas hüceyrədaxili maddə olan sitoplazmik matris; hüceyrə orqanoidləri eukariotların əsas funksional komponentləridir.
