İvan Dəhşətlinin ölümündən sonra "vətənsiz" dövrdə xəstə və zəif Fyodorla boyarlar hakimiyyət uğrunda açıq mübarizəyə başladılar. Onlardan ən güclüsü keçmiş opriçnik Qodunov idi. Teodorun ölümündən sonra Patriarx Əyyub yeni suveren seçmək üçün Zemski Soboru topladı. Patriarxın Şurası, Boyar Duması və xidmət adamları, Moskvanın ticarət və sənaye əhalisinin nümayəndələri bu kafedralda toplaşdılar. Ən çox ehtimal olunan namizədlər iki nəfər idi: çarın qaynı Boris Fyodoroviç Qodunov və Çar Fyodorun əmisi oğlu, Nikita Romanoviçin böyük oğlu - Fyodor Nikitiç Romanov.
Boris Qodunovun hakimiyyəti illəri Rusiya dövlətinin tarixində çətin bir dövrə təsadüf edir. Bu, 1598-ci ildən 1605-ci ilə qədər olan dövr idi. Əslində, gələcək çar artıq İvan Dəhşətlinin xəstə oğlu Fyodorun hakimiyyəti altında idi.
Boris Godunovun hakimiyyəti birmənalı şəkildə başladı. 1598-ci ilin fevralında Şura Borisə taxt təklif etdi, lakin o, rədd etdi. Onun razı olması üçün Borisin bacısı ilə qaldığı Qız monastırına dini yürüş təşkil edildi. Gələcək padşah taxta çıxmağa razılıq verməyə məcbur oldu. Beləliklə, Qodunovun seçilməsi populyar oldu. Bununla belə, eyni zamandagüman edilirdi ki, o, buna nail olmaq üçün gizli şəkildə təhdidlərə və rüşvətə əl atıb.
Boris krallıqla yalnız sentyabrın 1-də evləndi, xalqın seçkilərinin gücünə əmin oldu. Boris Godunovun hakimiyyəti bütün uzunluğu boyunca həddindən artıq ehtiyatla seçildi. Gücünə edilən cəhdlərdən qorxdu, ondan şübhələnən bütün boyarları məhv etdi. Onun əsl rəqibi yalnız Fedor Nikitich Romanov idi, nəticədə bütün Romanovlar suverenə qarşı sui-qəsd ittihamı ilə mühakimə olundu. Boyarlar çarı sevmirdilər, onu zadəganları təqib etməklə Dəhşətin varisi hesab edirdilər.
Boris Godunovun hakimiyyəti Fyodor siyasətinin davamı, daha doğrusu Qodunovun onun dövründə gördüyü işlər idi. O, hər vasitə ilə xalqın Qroznı dövründə pozulmuş rifahını bərpa etməyə çalışırdı. Xarici siyasətdə toqquşmalardan qaçmağa, yeni müharibələrdən çəkinməyə çalışırdı. O, ədalətin möhkəmlənməsinin qayğısına qalır, xalq üçün yaxşı hökmdar olmaq istəyirdi. O, doğrudan da sadə insanlara çoxlu faydalar verdi. Ardıcıl üç il, 1601-ci ildən, kütləvi aclıqdan ölümlərə səbəb olan məhsul çatışmazlığı baş verdi. Boris kral xəzinəsindən aclara pulsuz çörək paylaması təşkil etdi, insanlara gəlir gətirmək üçün paytaxtda böyük binalar tikdirdi.
Boris Godunovun hakimiyyəti aclıq, quldurluqla müşayiət olundu, lakin bu onun günahı deyildi. Ancaq bu, kraldan narazılığın artmasına səbəb oldu. Aclığın ardınca ikinci bir bədbəxtlik gəldi - özünü Tsareviç Dmitri elan edən xalq üsyanı. Bu mübarizə zamanı BorisQodunov gözlənilmədən öldü (1605).
Qodunov Avropa təhsilinə böyük əhəmiyyət verirdi. Kral texnologiya və tibb sahəsində xarici mütəxəssislərlə ünsiyyət qurur, onları həvəslə dövlət qulluğuna aparırdı. Gəncləri xarici ölkələrə göndərir, Moskva məktəblərini yad üsulla təşkil etməyi planlaşdırırdı. Xarici model üzrə almanlardan ibarət hərbi dəstə yaratdı. Godunovun dövründə Moskva hökuməti aydın Qərblə daha sıx əlaqələrə və Avropa biliklərinin mənimsənilməsinə meylli idi.
Deməli, Boris Qodunovun hakimiyyəti əksər tarixçilər tərəfindən qısa şəkildə təsvir olunur. Bir çoxları onun hakimiyyəti necə qanuni əldə etdiyinə şübhə ilə yanaşırlar, çünki onun əl işinin Uqliçdə Dəhşətli Tsareviç Dmitrinin kiçik oğlunun qətli olduğuna inanırlar.
