Afrikanın böyük çayları və gölləri qitə üçün çox mühüm rol oynayır, çünki onlar onu sulamaq və suvarmaq üçün istifadə olunur. Böyük çaylarda ümumi həcmi on beş kub kilometrdən çox olan bir sıra su anbarları yaradılmışdır. Onların ən böyüyü Nasser, Kariba və Volta kimidir. Böyük göllərin əksəriyyəti Şərqi Afrika Yaylasında yerləşir və xeyli dərinliyə malikdir. Məsələn, bütün planetdə bu göstəricidə Tanqanika yalnız Baykaldan sonra ikinci yerdədir. Onun ən dərin nöqtəsi suyun səthindən 1470 metr məsafədədir. Qitənin ən böyük gölü Viktoriyadır.
Reytinq "Afrikanın ən böyük çayları" Nil tərəfindən idarə olunur. Onun ümumi uzunluğu 6671 km-dir. Kagera çayı şəklində başlayır və bir neçə göldən keçdikdən sonra Ağ Nil adı ilə onlardan çıxır. Bundan əlavə, Xartum şəhəri yaxınlığında, Efiopiya dağlarında yerləşən Tana gölündən çıxan Mavi Nil ona axır. Afrikanın bu böyük çayları bir bütövlükdə birləşərək Nil adlanan çox geniş bir axar təşkil edir. Onun yuxarı axarlarında çoxlu sayda göllər, şəlalələr və sürətli çaylar var. Düzənlikdə çoxlu qollar və qollar görünür və buna görə də vadi kifayət qədər bataqlığa çevrilir. Bataqlıqların arxasında, axarda, sahil boyu dar ağac zolaqlarından bir növ yaşıl dəhliz əmələ gəlir. Sarı səhralar fonunda olduqca təzadlı görünür.
Çayın əhəmiyyətli bir hissəsi susuz səhra ilə əhatə olunub. Buna baxmayaraq, Nil xüsusilə yay və payız aylarında həmişə doludur. Afrikanın digər böyük çayları kimi, kənd təsərrüfatı üçün böyük əhəmiyyətə malikdir. Fakt budur ki, suyun azalmasından sonra torpağı mayalandıran lil təbəqəsi qalır. Bu, layiqli məhsul əldə etməyə imkan verir. Nil vadisinin bir neçə minilliklər əvvəl bəşəriyyətin əsl beşiyinə çevrilməsi təəccüblü deyil. Onun sayəsində kənd təsərrüfatı ilk dəfə məhz müasir Misir ərazisində yaranıb və planetdə ilk güclü dövlətlərdən biri formalaşıb.
"Afrikanın əsas çayları" siyahısında ikinci yeri 4320 km uzunluğunda olan Konqo tutur. Bütün Şərq yarımkürəsində ən bol hesab olunur. Çayın axarında ona qitənin cənub və şimal bölgələrindən çoxlu qollar bitişir. Mart-noyabr aylarında Konqo əsasən sağ qollarla, sentyabrdan mart ayına qədər isə sol qollardan qidalanır. Bunun izahı olduqca sadədir: fakt budur ki, materikin müxtəlif yarımkürələrində yağışlı mövsüm müxtəlif vaxtlara düşür. Bu nüans müsbət rol oynayır, çünki onun sayəsində çay il boyu tam axır.
Konqo Atlantik Okeanına töküldükdə nəhəng bir ağız əmələ gəlir, ona görə də oradan gələn su çayın çox dərinliyinə (17 kilometrə qədər) daxil olur. Onun təsiri altında okeanın səth suları ağızdan təxminən 75 kilometr məsafədə təzə qalır. Konqonun suları əvvəlcə qəhvəyi, sonra isə sarımtıl rəngdədir. Sahildən hətta üç yüz kilometr aralıda mavi okean suları ilə fərqlənir.
Afrikadakı digər böyük çaylar Niger (4160 km), Zambezi (2660 km) və Portağal çayıdır (1860 km).